В феврале 1958 г. самолеты Т.2В принимали участие в борьбе с партизанами в Западной Сахаре. Местные повстанцы перерезали коммуникации между испанскими опорными пунктами с целью заставить Испанию уйти из Северной Африки. Самолеты Т.2В базировались на аэродроме Гандо в Лас-Пальмосе на Канарских островах. Испанские Юнкерсы сбрасывали десанты, доставляли людей и грузы, несколько машин переоборудовали в бомбардировщики. Это был последний в истории случай боевого применения Ju-52/3m. Испания покинула Западную Сахару в 1969 г., территория отошла к Марокко.
С вооружения испанских ВВС самолеты CASA-352 начали снимать в 1965 г., процесс растянулся до 1978 г. В 1969 г. несколько машин из 71-й эскадрильи были перекрашены в цвета люфтваффе для съемок в кинофильме «Битва за Британию».
В настоящее время сохранилось 22 самолета CASA-352, часть из них пригодна к полетам, часть находится в экспозициях различных музеев. Один CASA-352L (серийный номер 067) принадлежит американской компании Commorative Air Force, самолет перекрашен в цвета люфтваффе, на него нанесен бортовой код «1Z+AR». Швейцарская компания Ju-Air Company переоснастила один CASA-352L (серийный номер 096) двигателями BMW-132, самолет регулярно принимает участие в различных авиашоу. Еще один CASA-352L (серийный номер 58, регистрационный код C-GARM) переделан в одномоторный Ju-52, он демонстрируется в коллекции Западно-Канадского авиационного музея в Виннипеге, провинция Манитоба.
Ju-52/3m на гражданской службе в послевоенные годы