Но вскоре Ставка Верховного Главнокомандования изменила и это решение, что было связано с начавшимся в конце августа Словацким национальным восстанием. Как уже отмечалось, идя навстречу просьбам руководства КПЧ и чехословацкого правительства, Советский Союз решил оказать немедленную помощь восставшим. С этой целью Ставка Верховного Главнокомандования приказала командующему 1-м Украинским фронтом срочно подготовить и провести наступательную операцию на левом крыле фронта из района Кросно, Санок на Прешов.
3 сентября командующий 1-м Украинским фронтом доложил в Ставку план проведения операции: