Учитывая недоведенность «Тауруса», стали искать более надежный двигатель и выбор в конечном итоге пал на американский мотор Пратт-Уитни «Твин Уосп», имевший большую мощность. Конструкторы Бристоль сконцентрировали усилия на создании мотора «Геркулес», предназначенного для тяжелых бомбардировщиков, не уделяя доводке «Тауруса» достаточного внимания. В качестве альтернативы рассматривалась также установка на самолет рядного мотора Ролл-Ройс «Мерлин» XX. «Бофорт» Gr.Mk.I N110 был построен без силовой установки, специально чтобы стать стендом для отработки моторов и, в конечном счете, на него установили два «Твин Уоспа» S3C4G мощностью по 1200 л.с. (вместо 1130 л.с. у «Тауруса»), В таком виде самолет стал прототипом для модификации «Бофорт» Gr.Mk.II и совершил первый полет 9 ноября 1940 года. Параллельно с ним создавался австралийский вариант Mk.II – L4448. Согласно отчету А&АЕЕ от 25 ноября 1941 года, № 110 при весе 9526 развивал с турбонагнетателем HS – 418 км/ч на высоте 4572 м и 407 км/ч на высоте 5486 м.
Модификация Gr.Mk.III с моторами «Мерлин»ХХ так и не была построена. Согласно расчетам, даже с установкой в консолях крыла топливных баков от «Бьюфайтера» Mk.II дальность полета уменьшалась на 65 км и, кроме того, двигатели с жидкостным охлаждением были более уязвимыми к боевым повреждениям. Предполагалось, что оснащенный «Мерлинами» «Бофорт» будет способен развивать максимальную скорость 508 км/ч на высоте 6096 м. Один серийный самолет, W6518, передали Роллс-Ройс для проведения такой модификации, но никаких работ на нем не проводилось.
Позднее недолго обсуждалась возможность создания «скоростного» «Бофорта» с моторами Бристоль «Геркулес», способного развивать на большой высоте скорость 486 км/ч.
Первый серийный «Бофорт» Mk.II. AW244, поднялся в воздух 17августа 1941 года, но первые десять машин были выпущены без радара ASV. К тому времени прекратились поставки турелей, которые использовались в самолетах первоначально, и их пришлось заменить турелями от «Бленхейма» с парой 7,7-мм пулеметов Браунинг. Замена оборонительного вооружения, а также усиление конструкции планера, введенные в серии, начиная с машины AW335, привели к появлению двух новых модификаций – 1А u ПА. Многие самолеты модификации Mk.I в тот период получили несколько усовершенствованные моторы «Таурус»ХП. Кроме того, в конце 1943 года стали устанавливать воздушные тормоза, которые позволяли «Бофорту» осуществлять пикирование на высокой скорости, но они оказались ненадежными в эксплуатации и в частях их фиксировали в убранном положении.
В то же время, чтобы удержать увеличивающийся вес «Бофортов» на приемлемом уровне, с самолетов снимали часть оборудования: радар, часть бронезащиты топливных баков и даже носовые пулеметы.
Моторы «Твин Уосп» имели полностью флюгируемыс винты, что значительно улучшало характеристики «Бофорта» при полете па одном двигателе, и были гораздо надежнее «Таурусов». Однако большей любовью у экипажей пользовались старые Mk.I, особенно оснащенные доработанными «Таурусами»Х11, которые были самыми быстрыми и маневренными среди всех «Бофортов». «Твин Уоспы» оказались идеально подходящими для самолетов, действовавших на Ближнем и Дальнем Востоке, поскольку они хорошо работали в горячем воздухе и обеспечивали большую дальность полета. Первым серийным «Бофортом» Mk.II, попавшим в строевую часть, стал AW252, прибывший в 217-ю эскадрилью 28 октября 1941 года. 25 ноября он отправился в первый боевой вылет.
Предложение о создании следующей модификации «Бофорта», Mk.IV, было сделано чиновникам Министерства Авиации 9 мая 1941 года. Самолет должен был получить новую турель с четырьмя пулеметами – по расчетам Бристоль это нововведение лишь незначительно сказывалось на летных характеристиках машины, но её взлетный вес увеличивался на 107 кг – до 9878 кг.