Иногда простые «ашки» переделывали в «салоны». В отличие от Ту-134АК у них не было задней входной двери. Обычно такие машины эксплуатировали частные компании, реже – правительственные отряды. При переоборудовании самолеты оснащали стационарной кислородной системой, предусматривалась возможность установки топливных баков в центроплане и переднего туалета по типу Ту-134АК. Таким образом переделали около 50 Ту-134А, причем некоторые позже снова стали линейными. Впрочем, три Ту-134А «салона» (LZ-TUK, зав. №1351209; OK-BYT, зав. №7349858 и СССР-65932, зав. №(33)66405) были изначально построены в таком виде.
Начиная с 1969 г., для 235-го ОАО и МО СССР создали 5 модификаций с аппаратурой спецсвязи и шифрования. Ее размещали в одном или двух спецотсеках в задней части салона, а снаружи эти самолеты отличали дополнительные антенны. Так, в 235-м ОАО были 27-местный и 29-местный варианты с системами «Татра», «Татра-М» и «Сургут-T» (в частности, СССР-65556, -65665, -65904 и -65911). Два 26-местных ВВСовских Ту-134АК (СССР-65680, зав. № (63)49020 и СССР- 65681, зав. № (73)49760) к 1980 г. были оснащены аппаратурой спецсвязи «Кар- паты-CT», наличие которой выдавал толстый гаргрот фюзеляжа.
Для советских ВВС и ВМФ на базе Ту-134АК был создан штабной самолет Ту-134 «Балканы» вместимостью 26 или 31 человек. Его легко опознать по характерной заостренной антенне КВ-радиостанции на переходнике под соплом ВСУ, направленной назад; по этой причине самолет в просторечии известен как «сто тридцать четвертый с жалом». Спецаппаратура самолета обеспечивала связь и работу командного состава на земле и в воздухе. Прототип (СССР-65980, зав. № (03)63207) поднялся в воздух 20 февраля 1986 г. Испытания закончились 30 октября, и Ту-134 «Балканы» был принят на вооружение. В этот вариант на минском АРЗ № 407 переделали около 40 Ту-134АК 1979-82 годов выпуска. Почти все они имели гражданские номера и «ливрею» Аэрофлота. Впрочем, были экземпляры с опознавательными знаками ВВС в красно- белой окраске – эта цветовая схема появилась в 1982 г. и вела свое происхождение из Группы советских войск в Германии (ГСВГ).
Большинство Ту-134 «Балканы» принадлежало 8-й авиадивизии особого назначения (Чкаловская). Служили они и в различных военных округах СССР, за его пределами, а также на всех четырех флотах. Так, СССР-63757былприписанкТихоокеанскому флоту, борт 100 красный – к Северному, СССР-63955 – к Белорусскому ВО, СССР- 63957 – к Киевскому ВО, СССР-63979 – к Туркестанскому ВО, СССР-65682 – к Московскому ВО, СССР-65985 – к Закавказскому ВО, борт 25 красный – к ГСВГ. Последний самолет 13 марта 1991 г. использовали для весьма щекотливой миссии – доставки из Берлина в Москву лидера бывшей ГДР Эриха Хонеккера, которого в объединенной Германии хотели судить. А 28 июля 1995 г. на Ту-134 «Балканы» RA-65988 прибыла в Грозный российская делегация на переговоры по прекращению Первой чеченской войны.
Со временем некоторые Ту-134 «Балканы» (например, EW-63955 ВВС Белоруссии, борт 63982 ВВС Украины, 4L-65993 ВВС Грузии) разоборудовали. При этом антенна под соплом ВСУ была снята, но ее переходник остался.
В 1975 г. по заказу авиакомпании «Авиогенекс» была создана разновидность варианта с радаром «Гроза-М134», которая в ряде источников обозначается Ту-134А-1. Ее особенность – задние аварийные выходы, увеличенные с 0,586x0,6 м до 0,916x0,6 м, чтобы обеспечить эвакуацию 86 пассажиров за время, установленное британскими нормами летной годности (иначе «Авиогенекс» могла потерять британский рынок). Таким образом, внешне самолет не отличим отТу-134Б. Разница же заключается в том, что Ту-134А-1 не имеет среднего пульта в пилотской кабине.
Прототипом Ту-134А-1 стал YU-AHX, доработанный на АРЗ № 407 в конце 1975 г. Зимой 1975-76 гг. переделали еще 3 машины: YU-AHY, -AJA и -AJD. С апреля 1976 г. по март 1980 г. Ту-134А-1 строили по спецзаказам: 4 самолета для «Авиогенекс» (YU-AJS, -AJV, -AJW и -ANE) и 2 (OK-HFM и -IFN) для чехословацкой авиакомпании CSA.