Оперативная Группа 38.3 контр-адмирала Шермана начала операции по воздушному патрулированию над заливом Лейте 27 октября. Она также выслала ударные истребительные группы, чтобы прочесать небо над Филиппинами. Эти самолеты разгромили маленький японский конвой и потопили эсминец, недавно входивший в состав соединения адмирала Куриты. Затем подошли оперативные группы 38.4 контр-адмирала Дэвисона и 38.2 контр-адмирала Богана. Оперативная Группа 38.1 вице-адмирала МакКейна еще раз зашла на Улити, где она находилась, когда начались бои за Лейте. Вскоре за ней на передовую базу ушли корабли контр-адмирала Шермана.
28 октября истребители Оперативной Группы 38.4 («Белло Вуд», «Энтерпрайз», «Франклин», «Сан Хасинто»), которая патрулировала возле Лейте, сбили вблизи авианосцев 13 японских самолетов, потеряв 4 своих. В этот же день японская подводная лодка атаковала авианосцы, но попаданий не добилась, зато сама была потоплена американскими эсминцами. На следующий день Оперативная Группа 38.2 («Интрепид», «Кэбот», «Хэнкок», «Индепенденс») атаковала аэродромы Лусона. Американцы сбили 71 японский самолет в воздухе и 13 уничтожили на земле. Потери американцев составили 11 самолетов, а около полудня пилот-самоубийца врезался в «Интрепид». Самолет попал в 20-мм зенитную установку, убив 10 человек и ранив 6. Корабль вскоре возобновил полеты. «Интрепид» стал первым из быстроходных авианосцев, на себе испытавших удары камикадзэ. Он отделался легко.
30 октября Оперативная Группа 38.2 находилась у берегов острова Самар, а Оперативная Группа 38.4 – в заливе Лейте. 5 камикадзэ подошли на большой высоте и сумели проскочить мимо воздушного патруля. Зенитный огонь разнес на куски 3 японских самолета. Четвертый врезался в авианосец «Франклин», проделав 40-фт дыру в полетной палубе, выбил кормовой элеватор и уничтожил 33 самолета. 56 человек были убиты, а 60 ранены. Пятый самолет тоже спикировал на «Франклин», но в последний момент отвернул. Его бомбы взорвались рядом с «Франклином», а сам он врезался в «Белло Вуд». Самоубийца попал в корму легкого авианосца, вызвав пожар, который длился несколько часов. 92 человека были убиты или пропали без вести, а 56 были серьезно ранены во время этой атаки. 12 самолетов были уничтожены.
Пока «Франклин» и «Белло Вуд» горели, еще 2 самоубийцы атаковали авианосцы, спикировав на «Энтерпрайз» и «Сан Хасинто». Оба были сбиты, хотя один горящий японец проскочил всего в 15 футах от забитой самолетами полетной палубы «Энтерпрайза».
Оба поврежденных авианосца в сопровождении эсминцев ушли на Улити, откуда отправились на ремонт в Соединенные Штаты.
Остатки Оперативной Группы 38.4 последовали за поврежденными кораблями на Улити, оставив у Филиппин только одну оперативную группу. Когда большая часть Оперативного Соединения 38 ушла, генерал МакАртур передал адмиралу Хэлси:
«Я шлю горячую благодарность и признательность вашим великолепным соединениям за прекрасную поддержку и помощь. Они сделали возможной операцию у Лейте. Мы так долго воевали вместе с вами, что привыкли и ожидали от вас блестящих успехов. Но вы превзошли самые смелые ожидания. Мы все ощущаем полную уверенность и спокойствие, когда вы вступаете в бой, поддерживая нас».
Последний день октября 1944 года застал 3 оперативные группы на якорной стоянке Улити. Авианосцы контр-адмирала Богана действовали возле Лейте, пока остальные отдыхали и пополняли запасы. Во время короткой стоянки на Улити Быстроходное авианосное соединение получило нового командира в лице вице-адмирала МакКейна, сменившего вице-адмирала Митчера. В свою очередь, контр-адмирал Альфред Монтгомери стал командиром Оперативной группы 38.1. Адмирал Митчер отбыл в Пирл-Харбор, а оттуда в Соединенные Штаты на короткий отдых. Он вернулся на авианосцы в начале 1945 года, когда адмирал Спрюэнс сменил адмирала Хэлси на посту командующего 3/5-м Флотом.
Для быстроходных авианосцев передышка оказалась недолгой. В последние дни октября камикадзэ брали высокую пошлину с американских кораблей за вход в залив Лейте. Японское командование продолжало перебрасывать на Филиппины все новые самолеты. Силы ВВС на Лейте были еще слишком слабы, и 2 авианосные группы были снова посланы к Филиппинам, чтобы помочь кораблям адмирала Богана. Оперативная Группа 38.4, ослабленная уходом «Франклина» и «Белло Вуда», осталась на Улити.
Адмирал Хэлси объединил 3 авианосные группы и повел их на север, чтобы атаковать Лусон. По пути соединение было атаковано японской подводной лодкой, которая попала торпедой в легкий крейсер. Поврежденный корабль был вынужден вернуться на Улити.