Однако Пфлауму не удалось найти понимания у представителей (Имперского министерства юстиции, которые заявили, что подобные намерения руководства "Лебенсборна" идут вразрез с законами. Более того, ему намекнули, что "Лебенсборн" противоправно пользовался покровительством Министерства внутренних дел. В этой связи министр внутренних дел Фрик в июле 1939 года направил рейхсфюреру СС Гиммлеру письмо, в котором сообщал, что, сохраняя тайну рождения внебрачных детей, тот нарушает множество законов и служебных инструкций. Вдобавок Фрик не видел никакого смысла в сохранении такой загадочности. Гиммлер и руководство "Источника жизни" были разочарованы подобной реакцией. Но пока "Лебенсборн" нарабатывал практику поиска лазеек и "обхода" законов, время работало на него. В 1942 году преемником умершего Имперского министра юстиции Гюртнера стал Отто Тирак. А год спустя Генрих Гиммлер сам возглавил Министерство внутренних дел. Подобные изменения в министерских креслах очень порадовали руководство "Источника жизни". Радостные ожидания оказались… оправданными. 27 октября 1943 года вышел Указ Имперского министерства юстиции, который освобождал "Лебенсборн" от контроля со стороны судов по делам опеки и позволял сохранять тайну рождения внебрачных детей. Разглашение этих сведений перед судом могло происходить только в отдельных случаях. В остальном суды должны были воздерживаться от проведения собственных расследований (это касалось и установления отцовства) и довольствоваться теми справками, которые предоставлялись им из "Лебенсборна". Фактически "Источник" стал полностью независимой от государственных и партийных органов организацией. Несколько месяцев спустя Министерство внутренних дел выпустило 4-е дополнение к (Закону "О гражданском состоянии". Оно добавляло в § 53 абзац, который позволял матерям "в единичных случаях" воздерживаться от сообщения о рождении ребенка в административные органы. Зато § 102а ("Свидетельство о рождении") вводил новый тип документа, в котором не значились имена родителей. Другая статья гласила, что в особых случаях для регистрации гражданского состояния предполагалось наличие "особых книг" и "особых служащих". По сути, речь шла только о "Лебенсборне", а по этой причине новые правила не могли быть всеобщими. Так, по сути, были легализованы специальные ЗАГСЫ "Лебенсборна". Однако приближавшийся военный крах Германии не позволил руководству "Источника" насладиться всеми благами от новых условий опеки.
В многолетних дискуссиях с министерской бюрократией о возможности сохранения тайны рождения "Источник жизни" смог достичь определенных успехов в других областях. Начавшаяся Вторая мировая война остро поставила перед немецким обществом проблему удостоверения внебрачных детей, оказавшихся на оккупированных Германией территориях. В обычных условиях данные случаи попадали бы под действие § 41 Закона "О гражданском состоянии", то есть эти эпизоды рассматривались бы в Центральном берлинском ЗАГСе. Однако Министерство иностранных дел предоставило "Лебенсборну" возможность создать специальный отдел в Мюнхенском централе, который должен был заниматься исключительно теми случаями, когда надо было скрывать рождение детей за пределами Германии. Напомню, что на тот момент дома "Источника" существовали и в Дании, и в Норвегии, и в Бельгии, и на территории оккупированных Польши и Нидерландов. До конца войны Берлинский ЗАГС № 1 не рассмотрел ни одного из этих дел. По мере распространения домов "Лебенсборна" по захваченной Европе было принято решение создать при Мюнхенском централе специальный отдел, который занимался бы только регистрацией актов гражданского состояния детей, рожденных от "арийских" иностранных родителей. Новая структура позволяла регистрировать также тайком вывозимых в Германию иностранных детей.