Сам Андрей Тимофеевич в предисловии к своему труду следующим образом изложил повод к его написанию: «В последние годы пребывания моего в Богородицке однажды осенью мне пришла мысль описать некоторые из известнейших и наиболее тогда употребительных в пищу пород яблок. Мне уже давно хотелось когда-нибудь на досуге заняться изучением этих столь полезных произведений натуры и не только описать самые лучшие и известнейшие сорта родящихся у нас в России яблок, но, если возможно, и, вникнув в их природу, составить для них характеристику и постараться открыть средство для удобного распознавания разных сортов их, которых у нас имеется бесчисленное множество. К этому побудило более всего меня то обстоятельство, что названия всех этих сортов были не повсеместно одинаковые, а один и тот же сорт яблок разными лицами назывался различно, так что разобраться в них было невозможно. Описаний же всех этих разнообразных сортов яблок и груш ни печатных, ни писаных у нас еще не было, и этот-то недостаток давно уже мне хотелось пополнить».
Работа Болотова представляет собой восемь томов. В первом из них изложены общая часть этого труда и научные принципы помологической системы, а в остальных семи содержится описание плодов, причем рисунки их даны в натуральную величину.
Ученому пришлось немало поработать, прежде чем он нашел надежные признаки, позволяющие четко отличать один сорт от другого. После долгих поисков он остановился на следующих характеристиках плода: устройстве «темени плода» и «воронки», толщине и гладкости кожицы, консистенции и вкусе, способности к хранению и характере заболевания гнилью, устройстве семенного гнезда, величине и форме семян.
Большое внимание уделял Болотов разведению ягодных культур. Ученый отмечал, что они имеют даже некоторые преимущества перед плодовыми деревьями, поскольку значительно раньше приступают к плодоношению, менее прихотливы к почвам, хорошо переносят самые суровые зимы, доставляют меньше хлопот при размножении и выращивании.
Вишню Болотов считал промежуточной культурой между плодовыми деревьями и ягодными кустарниками. Он описал низкие от природы вишни, у которых «...великое множество мелких и коротких ветвей и на них много мелких листьев». Андрей Тимофеевич отмечал, что эти сорта не требуют подчистки снизу (обрезки нижних сучьев), а для большей густоты у них следует укорачивать верхние и боковые побеги. Такие вишни, кроме получения ягод, могут быть использованы в декоративных целях для обсаживания дорожек. Кроме того, ученый различал сорта, растущие более высоко и требующие подчистки, а также вишневые деревья, дающие большую урожайность.
Классифицируя различные сорта вишен по степени окультуренности и качеству плодов, Болотов описал: Магалебскую или духовитую, дикую, канадскую, лесную дикую, а также садовую вишни.
Весьма критически относился Андрей Тимофеевич к практике некоторых хозяев, беспорядочно размещавших кусты или деревья вишни в саду. Он утверждал, что рациональное использование земли и растений возможно олько тогда, когда вишни посажены рядами как в продольном, так и в поперечном направлении. Густота посадки должна определяться размерами вырастающего дерева или куста.
Болотов писал: «Чем вишни растут выше и занимают сбою более места, тем далее должно рядам сим быть расстоянием друг от друга; а чем ниже растут вишни, тем чаще: для помянутого низкого ряда довольно, если они будут на сажень друг от друга или еще несколько ближе, для высоких мало и четырех аршин. А таким же образом в самых рядах должны они быть сажаемы сообразно с их ростом и высокие ряды реже, например, аршина на два одно дерево от другого; а низкого рода вишни можно садить и на один аршин».
В основу рекомендаций по формированию кроны у вишни Болотов положил закономерности закладки почек.
Ученый писал, что плоды у вишни завязываются на побегах, выросших в предыдущее лето. В соответствии с этим крону следует формировать таким образом, чтобы каждый год этих побегов вырастало как можно больше. Для этого нужно, чтобы в ранние годы на вишне закладывалось больше главных сучьев и чтобы эти сучья, в свою очередь, «...были не голенастые, но в самом почти своем начале опять на многие другие, а сии потом на множайшие раздроблялись».
Андрей Тимофеевич рекомендовал у вишен высотой полтора-три аршина обрезать примерно на треть всю вершину и укорачивать боковые верхние сучья так, чтобы остались лишь пеньки 3-4 вершка длиной. Он писал, что это вынудит обрезанные сучья образовать большое количество боковых побегов. На следующий год весной эти побеги обрезать с оставлением пеньков длиною в 2-3 вершка. Такую операцию повторять каждый год. В результате развивается густая шапкообразная крона. Кроме того, Болотов советовал удалять корневые отпрыски появляющиеся рядом с деревом.