Документы, подтверждающие смерть Гитлера, по линии «Смерш» и НКВД были направлены из Берлина для доклада руководству страны только в конце мая 1945 года. 16 июня Л.П.Берия доложил И.В.Сталину и В.М.Молотову об актах опознания останков фюрера и результатах экспертиз, а также о показаниях свидетелей из числа задержанных немцев. Официальные заявления Советского правительства об итогах работы по поиску Гитлера и его окружения, документы дентологических и других исследований по опознанию трупов главных нацистов не обнародовались. Здесь вполне могли присутствовать политические мотивы, но также имели место некоторые сомнения руководителей ведомств госбезопасности и внутренних дел в отношении результатов проверок и идентификации останков фашистских главарей.
Не случайно на пресс-конференции у маршала Г.К. Жукова и А.Я. Вышинского, о чем сообщила газета «Правда» 10 июня 1945 года, корреспондент Ал. Верт задал полководцу вопрос: «Имеете ли Вы какое-нибудь представление или мнение о том, что случилось с Гитлером?» Жуков ответил: «Обстановка очень загадочная. Из найденных нами дневников адъютантов немецкого главнокомандующего известно, что за два дня до падения Берлина Гитлер женился на киноактрисе Еве Браун. Опознанного трупа Гитлера мы не нашли. Сказать что-либо утвердительно о судьбе Гитлера я не могу. В самую последнюю минуту он смог улететь из Берлина, так как взлетные дорожки позволяли это сделать».
В январе 1946 года начальник Главного управления по делам военнопленных и интернированных (ГУПВИ) НКВД СССР генерал-лейтенант А.З.Кобулов подписал аналитическую справку о версии самоубийства Гитлера. В ней отмечены некоторые сомнения, основанные на отдельных противоречиях в показаниях свидетелей. В частности, были поставлены вопросы: почему ни один из источников не говорит, что стало с останками Гитлера в дальнейшем после их сожжения; почему нет данных о вызове врача для констатации смерти; почему имеются различия в показаниях о выносе тел в сад рейхсканцелярии и об участниках этой процедуры (кто выносил, а кто только сопровождал); почему различны мнения свидетелей о внешнем виде выносимых останков; до конца ли были сожжены трупы главных нацистов; почему останки были обнаружены солдатами взвода «Смерш» раньше, чем на это место показал немецкий охранник Менгесхаузен, и так далее. Любопытно, что относительно свидетельства Менгес-хаузена в справке отмечено: «Он единственный дал показания о закопке трупов, оказавшиеся правильными».
На основании таких, по мнению авторов документа, «серьезных противоречий» предлагалось объединить все имеющиеся материалы Оперативного управления ГУПВИ НКВД, ГУКР «Смерш» НКО СССР и аппарата Серова в Берлине для «тщательной и жесткой перепроверки всей группы фактов». Может быть, Кобулова и его подчиненных, помимо отмеченных ими противоречий, смущал и тот факт, что после захвата имперской канцелярии, 4 мая 1945 года был обнаружен труп двойника фюрера — Густава Велера (этот сюжет был отснят на кинопленку).
В результате инициативы ГУПВИ специально созданная комиссия в 1946 году провела дополнительные раскопки на месте обнаружения трупов Гитлера и Евы Браун. При этом был найден фрагмент черепа. В акте записали: «Левая теменная часть черепа с выходным пулевым отверстием». Следует заметить, что в акте экспертизы от 8 мая 1945 года при обследовании останков обгоревших трупов было отмечено, что «крышка черепа частично отсутствует». В ходе дополнительного расследования в бункере нашли следы крови на обивке дивана, на котором, по описанию Линге, фюрер покончил жизнь самоубийством.
В связи с передислокацией отдела контрразведки «Смерш» 3-й ударной армии трупы, которые исследовались в мае 1945 года, были уже в начале июня перезахоронены в лесу в районе города Ратенов. По указанию начальника УКР «Смерш» Группы советских оккупационных войск в Германии генерал-лейтенанта П.В.Зеленина, 21 февраля 1946 года останки были перезахоронены на территории военного городка в Магдебурге, где располагался отдел контрразведки «Смерш» 3-й ударной армии. Причем результаты повторных исследований также в то время не оглашались.
По всей вероятности, смерть Гитлера и все обстоятельства вокруг этого события сразу стали важным элементом политической игры между союзниками по антигитлеровской коалиции. Думается, что Сталин это прекрасно понимал и умело использовал во взаимоотношениях с Западом. Многочисленные свидетельские показания и результаты опознаний и медицинских экспертиз подтвердили факт гибели Гитлера. Но Сталин не торопился с обнародованием этих выводов. Он рассчитывал свои политические ходы на много лет вперед. Тем более что был и свой исторический опыт: последнего русского царя Николая II расстреляли без суда и следствия, хотя звучали требования устроить всенародный суд. Более того, тело погибшего императора было тщательно спрятано. Большевики делали расчет на то, что монархические силы лишатся символа, вокруг которого они могли объединиться для борьбы с Советской властью.