Параллельно Штольце продолжал работать с агентурой в Словакии, Югославии и Польше. Заброшенные в эти страны еще в бытность его заместителем начальника отдела «Абвер–2» агенты—радисты и саботажники продолжали исправно поставлять развединформацию и успешно проводить диверсии. С помощью некоего Вебера, бежавшего из Бухареста румынского фольксдойче, Штольце установил контакты с профашистски настроенными кругами румынских эмигрантов в Швейцарии. Штольце не оставлял попыток проведения диверсионно—разведывательных операций и на территории СССР: так, по его приказу в нейтральную Швецию был переправлен радиоинженер с заданием организовать там разведцентр по сбору информации о дислокации воинских частей, местоположении военных объектов Красной Армии и т. п. в Прибалтийских республиках. Несколько агентов были заброшены в Испанию с приказом внедриться в легальный бизнес и ждать дальнейших указаний.
Однако важнейшей задачей оберста Штольце в последние месяцы 2–й мировой войны было создание рассчитанной на послевоенный период агентурной сети в Восточной Германии и в самом Берлине. Группе «Штольце» (помимо самого оберста в нее входили оберстлейтенант Собчик и майор фон Странски, бывший руководитель отделения абвера в Бухаресте) удалось завербовать 800 человек.
Советских контрразведчиков интересовал вопрос, чем конкретно занимался Штольце в последние дни в Берлине. Во время допроса, состоявшегося 14 июля 1947, оберст Штольце показал:
«…В начале апреля 1945 руководитель 6–го управления РСХА (Аусланд. ГС), бригаденфюрер СС Вальтер Шелленберг, издал директиву, в которой был определен порядок действий в случае угрозы захвата Берлина частями РККА: заблаговременно подготовить фиктивные документы, уничтожить оперативную документацию, всем сотрудникам управления скрыться и ждать особых распоряжений. Я выполнил этот приказ…»
Из показаний оберста Штольце
«… Включение абвера в структуру Верховного главнокомандования вермахта позволяло адмиралу Канарису, начальнику военной разведки и контрразведки рейха, напрямую обращаться к высшему военному руководству и фюреру как Верховному главнокомандующему вооруженными силами со всеми имеющимися просьбами, пожеланиями, требованиями и предложениями. Так, при решении «Су—детской проблемы» Канарис предложил начальнику штаба ОКБ Кейтелю (или даже самому фюреру) наряду с агентами абвер–2 использовать и членов Судетско—немецкой партии (СНП) для проведения подрывной деятельности среди личного состава чешской армии. Фюрер одобрил проведение этой операции с учетом высказанных адмиралом предложений.
Сведение всех служб военной разведки и контрразведки в одну управленческую структуру и утверждение принципа единоначалия позволили не только эффективно использовать разведывательные ресурсы, но и унифицировать деятельность отделов, отделений и филиалов. Кроме этого в ходе ежедневных оперативных совещаний в штаб—квартире Канариса руководители подотделов, секторов и групп получали в общих чертах информацию о различных операциях своих коллег и могли договориться о взаимодействии через начальников соответствующих отделов. На таких совещаниях практиковался и обмен оперативной информацией по кругу взаимно интересующих проблем, что благотворно сказывалось на выполнении возложенных на абвер задач. Так, при обсуждении и разработке индивидуальных планов боевых действий отделов «Абвер–1», «Абвер–2» и «Абвер–3» в рамках операции «Барбаросса» Пикенброк узнал о намерениях использовать формирования украинских эмигрантов в диверсионных операциях на территории СССР и, заручившись поддержкой Канариса, обратился к Лахузену с предложением использовать украинских диверсантов абвер–2 в оперативных целях абвер–1. После всестороннего обсуждения было принято решение о целесообразности проведения совместных операций.
Абвер образца 1938 г. отличался от германской военной разведки времен 1–й мировой войны и военных разведок большинства европейских стран, построенных по образу и подобию «Второго бюро» французского Генштаба, прежде всего тем, что разведслужбы трех составных частей вермахта (армия, люфтваффе и кригсмарине) были объединены в одном отделе — абвер–1. Прежде разделение разведслужб неизбежно приводило к соперничеству и конкуренции, что отрицательно сказывалось на общем руководстве вооруженными силами. Теперь развединформация поступала централизованно, а это позволяло вести сбалансированную политику развития всех родов войск и способствовало значительному повышению боеспособности вермахта во время войны.